氫分子作為一種疾病治療分子,其的優勢在于安全性、有效性、便利性和充足性。氫氣可以通過抗氧化、減少細胞凋亡、抑制炎癥反應等發揮對各種疾病和損傷的治療作用。用氫氣治療疾病主要包括呼吸氫氣、電解水、氫氣溶解水、氫氣溶解注射液、氫氣注射、經過皮膚擴散和誘導大腸細菌產生氫氣等方式和手段。在這些方式和手段中，電解水作為一種功能水，已經在國際上應用多年。
氫氣醫學發展至今，無論從基礎臨床還是從研究到應用，都取得了十分顯著的成果。1%-4%的氫氣具有很強的疾病治療功效，它能穿透生物膜到達細胞核和線粒體，并且可以通過氣體擴散穿透血腦屏障從而有效抵達病灶，這是多數抗氧化物質所不具備的特征。
一、局部利用氫氣的技術
局部利用氫氣的技術包括利用氫氣，該技術曾經被用于視網膜缺血的研究，通過反復滴眼，證明對視網膜缺血再灌注損傷具有明顯的治療作用。盡管只有這一項研究，但該研究提示，使用氫氣對眼科疾病具有潛在而廣泛的應用前景。
二、氫氣水皮膚涂抹和沐浴
由于氫氣的擴散能力非常強，氫氣沐浴可以作用經過皮膚攝取氫氣的手段，有學者曾經結合飲用和局部涂抹氫氣水治療皮膚炎癥損傷，大部分在一到二周內獲得顯著的治療效果。除通過氫氣溶液局部使用外，身體局部攝取氣體的方法曾經用于二氧化碳的吸收，如果將身體局部甚至大部分密閉在氫氣環境中，依靠氫氣的巨大擴散能力，也可以作為一種使用氫氣的方法。不過目前這種方法尚未見報道。
三、氫氣注射
中山醫科大學有學者對比腹腔注射氫氣和氫氣鹽水對全腦缺血的治療效果，由于氫氣在水中的溶解度比較低，直接注射氫氣可以獲得比同樣體積液體60倍以上的氫氣攝取量，因此從理論上這種注射方法可以大大提高氫氣的利用率。注射氫氣的缺點是可能引起注射部位的氣腫或感染，因此這種方法的安全性和有效性尚需要更多研究。
四、誘導腸道細菌產生氫氣
口服人體小腸不吸收的藥物和食物，由于小腸不吸收，這些成分被運輸到大腸，可以被大腸內細菌吸收，大腸內有許多可以產生氫氣細菌，這些細菌利用這些能量物質制造大量氫氣。有學者曾經證明，口服阿卡潑糖、變性淀粉、牛奶、姜黃素、等可以促進體內氫氣的產生。這種手段已經有一些研究，但效果目前尚難以確定。
此外，組織內的氫氣濃度易于檢測，通過使用電極測量可以輕松實現對氫氣擴散的實時監測。氫氣給藥已在多種疾病模型和人類疾病中顯示出預防及治療效果，國內在一些疾病中也進行了一些臨床及基礎研究。
